DERS TANITIM ve UYGULAMA BİLGİLERİ
| Dersin Adı | Kodu | Yarıyıl | T+U+L (saat/hafta) | Türü (Z / S) | Yerel Kredi | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Biyoinformatik | BIO 511 | Bahar | 03+00+00 | Zorunlu | 3 | 7.5 |
| Akademik Birim: | |
| Öğrenim Türü: | Örgün eğitim |
| Ön Koşullar | Yok |
| Öğrenim Dili: | İngilizce |
| Dersin Düzeyi: | Yüksek Lisans |
| Dersin Koordinatörü: | Kemal YELEKÇİ |
| Dersin Amacı: | Moleküler biyoloji ve bilgisayar bilimlerinin buluştuğu disiplinlerarası bir bilim dalı olan biyoinformatik hakkında genel bir bakış sunmak, milyonlarca nükleotid ya da amino asitlerden oluşan dizileri sıradan bir kişisel bilgisayarda analiz edebilme ve sonrasında uygulanan analizler sayesinde biyolojik sistemlere ait yapı ve mekanizmanın açığa çıkartılması ile hastalıklara sebep olan mekanizmanın belirlenmesi ve tedavisinin mümkün kılınmasına giden yol haritasını göstermek. |
| Dersin İçeriği: | Biyoinformatiğe genel bakış, Sekans ve literatürdeki her türlü veriye ulaşma yöntemleri, İkili dizi hizalama, BLAST, İleri BLAST teknikleri, Çoklu dizi hizalama, Protein Yapı ve Tahmini, İlaç Tasarımına genel bakış. |
| Dersin Öğrenme Çıktıları (ÖÇ): | |
| Dersin Öğrenme Yöntem ve Teknikleri | Projektör / Slaytlar |
HAFTALIK PROGRAM
| Hafta | Konular | Ön Hazırlık |
|---|
Kadir Has Üniversitesi'nde bir dönem 14 haftadır, 15. ve 16. hafta sınav haftalarıdır.
ZORUNLU ve ÖNERİLEN OKUMALAR
| Bioinformatics and Functional Genomics, by J. Pevsner, Wiley-Liss 2009 |
DİĞER KAYNAKLAR
| Bioinformatics: Sequence and Genome Analysis, by D.Mount, 2004 Bioinformatics for Dummies, Claverie JM and Notredame C, 2nd ed, Wiley 2007. Computational Text Analysis for Functional Genomics and Bioinformatics, RayChaudhuri S, Oxford U Press, 2006 Structural Bioinformatics, Bourne PE and Weissig H, John Wiley & Sons, 2003 Essential Bioinformatics, Xiong J, Cambridge U Press, 2006. Bioinformatics: A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins, by A.D.Baxevanis and B.F.F. Ouellette, Wiley Interscience, 3rd ed., 2004. Problems and Solutions in Biological Sequence Analysis, by Borodovsky and Ekisheva, Cambridge University Press 2006. Bioinformatics: Sequence Alignment and Markov Models, by K.R.Sharma, McGraw Hill 2009. |
DEĞERLENDİRME SİSTEMİ
| Yarıyıl İçi Çalışmaları | Sayı | Katkı Payı (%) |
|---|---|---|
| Total: | 0 | 0 |
İŞ YÜKÜ HESAPLAMASI
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Toplam İş Yükü (saat): | 0 | ||
1 AKTS = 25 saatlik iş yükü
PROGRAM YETERLİLİKLERİ (PY) ve ÖĞRENME ÇIKTILARI (ÖÇ) İLİŞKİSİ
| # | PY1 | PY2 | PY3 | PY4 | PY5 | PY6 | PY7 | PY8 |
Katkı Düzeyi: 1 Düşük, 2 Orta, 3 Yüksek