DERS TANITIM ve UYGULAMA BİLGİLERİ

Dersin Adı Kodu Yarıyıl T+U+L (saat/hafta) Türü (Z / S) Yerel Kredi AKTS
Temel Hücre Biyolojisi BIO 531 Güz 03+00+00 Zorunlu 3 8.0
Akademik Birim: Biyoinformatik ve Genetik
Öğrenim Türü: Örgün eğitim
Ön Koşullar Yok
Öğrenim Dili: Türkçe
Dersin Düzeyi: Yüksek Lisans
Dersin Koordinatörü: Hatice Bahar ŞAHİN
Dersin Amacı: Biyolojinin temel kavramlarının tekrar edilmesi.
Protein yapısı ve aktivitesinin temelleri, nükleik asit yapısı ve sıkıştırılması, DNA kopyalanması, transkripsiyon ve translasyon, ve bu olayların kontrolünün öğretilmesi.
Dersin İçeriği: Biyolojinin temel kavramlarının anımsanması. Protein yapısı, katlanması ve aktivitesinin temelleri. DNA yapısı, DNA sıkıştırılması, kromatin yapısı ve yapısının değişmesi. DNA kopyalanma mekanizması, DNA tamir mekanizması ve rekombinasyon. Transkripsiyon, translasyon ve bunların kontrolü. Gen ifadesinin çeşitli basamaklarda kontrolü, ve hücre davranışı.
Dersin Öğrenme Çıktıları (ÖÇ):
  • 1- Protein structure, protein folding and enzymatic activity.
  • 2- DNA structure, DNA compaction, and chromatin formation and control via remodeling.
  • 3- DNA replication mechanism, DNA repair mechanism, DNA recombination mechanism and usage of these techniques for engineering purposes.
  • 4- Transcription and the control of transcription. RNA processing mechanism. RNA world hypothesis.
  • 5- Translation mechanism and regulation. Post-translational processes.
  • 6- Cell specific gene expression regulation at the level of transcription, post-transcription, translation and post-translation, and how these regulations affect the cell character. Using these mechanisms for engineering purposes.
  • 7- Reading research articles, improving assay writing and scientific presentations.
Dersin Öğrenme Yöntem ve Teknikleri Açıklayıcı görseller ve pratik hayata dair örnekler de içeren MS-PowerPoint sunumları. Bu sunumlar dersin hemen akabinde BlackBoard platformu üzerinden öğrenciler ile de paylaşılmaktadır. Tahta üzerinde konuyu, renk kodu kullanarak açıklama (öğrencilerin fotoğraf çekmesine izin verilmektedir). Ders esnasında öğrenciler ile kurulan diyalog. Ders esnasında konu ile alakalı izlenen mekanistik/açıklayıcı videolar. Bu videolar dersin akabinde öğrenciler ile de paylaşılmakta ve tekrar izlemeleri tavsiye edilmektedir.


HAFTALIK PROGRAM

HaftaKonularÖn Hazırlık ÖÇ
1 Ch1: Cells and Genomes Resim ve video destekli sunum 2
2 Ch3: Proteins Resim ve video destekli sunum 1
3 Ch3: Proteins Resim ve video destekli sunum 1
4 Ch4: DNA, Chromosomes and Genomes Resim ve video destekli sunum 2
5 Ch4: DNA, Chromosomes and Genomes Resim ve video destekli sunum 2
6 Ch5: DNA Replication, Repair and Recombination Resim ve video destekli sunum 3
7 Ch5: DNA Replication, Repair and Recombination Resim ve video destekli sunum 3
8 Arasınav
9 Ch6: How the Cells Read the Genome: From DNA to Protein Resim ve video destekli sunum 4
10 Ch6: How the Cells Read the Genome: From DNA to Protein Resim ve video destekli sunum 4
11 Ch6: How the Cells Read the Genome: From DNA to Protein Resim ve video destekli sunum 5
12 Ch7: Control of Gene Expression Resim ve video destekli sunum 6
13 Ch7: Control of Gene Expression Resim ve video destekli sunum 6
14 Makale sunumu Öğrenci sunumları 7


ZORUNLU ve ÖNERİLEN OKUMALAR

Ders kitabı:
Molecular Biology of the Cell, 6th Edition ISBN-13: 978-0-8153-4432-2 or 978-0-8153-4464-3
Authors: Bruce Alberts, Alexander Johnson, Julian Lewis, David Morgan, Martin Raff, Keith Roberts, Peter Walter.


DİĞER KAYNAKLAR

"https://www.khanacademy.org/" adresinden önerilen videolar
"https://www.youtube.com/channel/UCcSThfV7yiW9I5hXBnEk9Zg" Virtual Cell adresinden önerilen videolar


DEĞERLENDİRME SİSTEMİ

Yarıyıl İçi ÇalışmalarıSayıKatkı Payı (%)
Katılım - -
Laboratuvar - -
Uygulama - -
Arazi Çalışması - -
Proje - -
Ödev 3 15
Sunum/Jüri 1 10
Derse Özgü Staj - -
Diğer Uygulamalar (seminer, stüdyo kritiği, workshop vb.) - -
Dersle İlgili Sınıf Dışı Etkinlikler (okuma, bireysel çalışma vb.) - -
Ara Sınavlar/Sözlü Sınavlar/Kısa Sınavlar 1 30
Final Sınavı 1 45
Total: 6 100


İŞ YÜKÜ HESAPLAMASI

EtkinliklerSayısıSüresi (saat)Toplam İş Yükü (saat)
Ders Saati14342
Laboratuvar000
Uygulama000
Arazi Çalışması000
Proje000
Ödev31236
Sunum/Jüriye Hazırlık11212
Derse Özgü Staj000
Diğer Uygulamalara Hazırlık000
Dersle İlgili Sınıf Dışı Etkinlikler000
Ara Sınavlar/Sözlü Sınavlar/Kısa Sınavlar14444
Final Sınavı16666
Toplam İş Yükü (saat):200


PROGRAM YETERLİLİKLERİ (PY) ve ÖĞRENME ÇIKTILARI (ÖÇ) İLİŞKİSİ

# PY1 PY2 PY3 PY4 PY5 PY6 PY7 PY8
OC1 1     3        
OC2 1     3        
OC3       3        
OC4       3        
OC5       3        
OC6       3        
OC7             1 3