DERS TANITIM ve UYGULAMA BİLGİLERİ
| Dersin Adı | Kodu | Yarıyıl | T+U+L (saat/hafta) | Türü (Z / S) | Yerel Kredi | AKTS |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Biyopython | MBG 309 | Güz | 02+00+02 | Seçmeli | 3 | 6 |
| Akademik Birim: | Moleküler Biyoloji ve Genetik |
| Öğrenim Türü: | Örgün Eğitim |
| Ön Koşullar | - |
| Öğrenim Dili: | İngilizce |
| Dersin Düzeyi: | Lisans |
| Dersin Koordinatörü: | Şebnem Eşsiz |
| Dersin Amacı: | Öğrencilerin şunları yapması beklenir: • Hesaplamalı problem çözme konusunda bir anlayış kazanın. • Hesaplamalı düşünme kavramlarını öğrenin. • Python'da programlama konusunda bir anlayış kazanın. • Bio-Phyton modülünde bir anlayış ve deneyim kazanın • Protein hiyerarşik sınıflandırma yöntemini öğrenin. |
| Dersin İçeriği: | |
| Dersin Öğrenme Çıktıları (ÖÇ): |
|
| Dersin Öğrenme Yöntem ve Teknikleri | Öğrenciler, proteinler ve DNA / RNA analizi üzerine biopyton uygulamaları için uygulamalı uygulamalara sahip olacaklar. |
HAFTALIK PROGRAM
| Hafta | Konular | Ön Hazırlık |
|---|---|---|
| 1 | Kurs Tanıtımı ve Proteinlerin temel yapısal özelliklerinin gözden geçirilmesi | Okuma |
| 2 | Programlamayı, bilgisayar dilini ve algoritmaları anlama. | Okuma |
| 3 | Bilgisayar dillerinin sınıflandırılması ve algoritmalara giriş | Okuma |
| 4 | Değişkenin anlamını anlamak; değişken türleri ve özellikleri. | Okuma |
| 5 | Operatörleri ve komutları öğrenmek; matematiksel ifadeler. Farklı veri türlerini, dizileri ve kontrol yapılarını anlama; koşul ifadeleri ve döngüler. |
Okuma |
| 6 | Python'da Öğrenme Organizasyonu: fonksiyonlar, modüller ve biçimlendirilmiş girdi / çıktı ve dosya işlemleri. | Okuma |
| 7 | Ara Sınav ve Gözden Geçirme | |
| 8 | Nesne yönelimini, sınıfları ve miras diyagramlarını anlama | Okuma |
| 9 | Nesne yönelimini, sınıfları ve miras diyagramlarını anlama | Okuma |
| 10 | Hesaplamalı biyoloji, biopython modülü ve proteinlerin hiyerarşik sınıflandırması için python kullanma | Uygulamalı eğitim |
| 11 | Hesaplamalı biyoloji, biopython modülü ve proteinlerin hiyerarşik sınıflandırması için python kullanma | Uygulamalı eğitim |
| 12 | LINUX işletim sistemi | Uygulamalı eğitim |
| 13 | BIOPYTHON ile PROJE | Yardım dokümanları |
| 14 | Final sınavı | Okuma |
Kadir Has Üniversitesi'nde bir dönem 14 haftadır, 15. ve 16. hafta sınav haftalarıdır.
ZORUNLU ve ÖNERİLEN OKUMALAR
| “Learning Python” by Mark Lutz and David Ascher printed by O’Reilly Media ISBN 978-0-596-00281-7 |
DİĞER KAYNAKLAR
| (Mandatory) DOWNLOAD PYTHON 2.7 to your own computer from http://www.python.org/download/releases/2.7.3/ (Optional) DOWNLOAD CYGWIN to have LINUX operating system http://www.cygwin.com/ MIT open courseware: Introduction to Computer Science and Programming 6-00 |
DEĞERLENDİRME SİSTEMİ
| Yarıyıl İçi Çalışmaları | Sayı | Katkı Payı (%) |
|---|---|---|
| Katılım | 14 | 10 |
| Proje | 1 | 25 |
| Sunum/Jüri | 1 | 5 |
| Ara Sınavlar/Sözlü Sınavlar/Kısa Sınavlar | 1 | 25 |
| Final Sınavı | 1 | 35 |
| Total: | 18 | 100 |
İŞ YÜKÜ HESAPLAMASI
| Etkinlikler | Sayısı | Süresi (saat) | Toplam İş Yükü (saat) |
|---|---|---|---|
| Ders Saati | 14 | 3 | 42 |
| Proje | 1 | 30 | 30 |
| Ara Sınavlar/Sözlü Sınavlar/Kısa Sınavlar | 1 | 30 | 30 |
| Final Sınavı | 1 | 48 | 48 |
| Toplam İş Yükü (saat): | 150 | ||
1 AKTS = 25 saatlik iş yükü
PROGRAM YETERLİLİKLERİ (PY) ve ÖĞRENME ÇIKTILARI (ÖÇ) İLİŞKİSİ
| # | PY1 | PY2 | PY3 | PY4 | PY5 | PY6 | PY7 | PY8 | PY9 | PY10 | PY11 |
| OC1 | |||||||||||
| OC2 | |||||||||||
| OC3 | |||||||||||
| OC4 | |||||||||||
| OC5 | |||||||||||
| OC6 | |||||||||||
| OC7 | |||||||||||
| OC8 | |||||||||||
| OC9 |
Katkı Düzeyi: 1 Düşük, 2 Orta, 3 Yüksek