BOLOGNA | AKTS Bilgi Paketi ve Ders Kataloğu

DERS TANITIM ve UYGULAMA BİLGİLERİ

Dersin Adı	Kodu	Yarıyıl	T+U+L (saat/hafta)	Türü (Z / S)	Yerel Kredi	AKTS
Protein Katlaması	MBG 323	Bahar	03+00+00	Seçmeli	3	5

Akademik Birim:	Moleküler Biyoloji ve Genetik
Öğrenim Türü:	Örgün Eğitim
Ön Koşullar	Yok
Öğrenim Dili:	İngilizce
Dersin Düzeyi:	Lisans
Dersin Koordinatörü:	- -
Dersin Amacı:
Dersin İçeriği:
Dersin Öğrenme Çıktıları (ÖÇ):	1- Protein yapısı tahmini için geliştirilmiş teknikleri kavramak. 2- Hesaplamalı yapı tahmin tekniklerini anladığını örnekleri ile açıklayabilmek. 3- Deneysel verilerin hesaplamalı protein yapısı tahmin araçları ile birlikte kaynaştırabilmek. 4- Protein katlanmasının termodinamiği hakkında bir anlayış kazanın. 5- Globüler ile membran proteinlerinin yapısal özellikleri arasındaki farklılıkları anlamak ve bu yapıları protein yapı tahmin uygulamalarıyla kavrayabilmek.
Dersin Öğrenme Yöntem ve Teknikleri

Hafta	Konular	Ön Hazırlık
1	Kısaca Proteinler	Protein Yapısına Giriş. Çelenk Yayıncılık
2	Proteinlerin yapısal sınıflandırması	Ders Notları
3	Olasılık ve Entropi	Moleküler İtici Kuvvetler, Bölüm 1
4	Entropinin multiplisitesi ve istatistiksel tanımı	Moleküler İtici Kuvvetler, Bölüm 2
5	Protein Katlanmasının Termodinamiği I	Ders Notları
6	Protein Katlanmasının Termodinamiği II	Ders Notları
7	Genel Bakış	Ders Notları ve PDF Dosyaları
8	Ara Sınav	Ara sınav ve çözümleri
9	Protein Geometrisi & Optimizasyon Teknikleri	Yapısal Biyoinformatik, 7. Bölüm
10	Deneysel Teknikler	Proteinler: Yapı ve İşlev
11	Homoloji Modelleme	Yapısal Biyoinformatik, 7. Bölüm. https://salilab.org/modeller/
12	Homoloji Modelleme Uygulama Eğitimi	https://salilab.org/modeller/
13	Proje
14	Membran Proteinleri	Proteins: Structure and Function

Kadir Has Üniversitesi'nde bir dönem 14 haftadır, 15. ve 16. hafta sınav haftalarıdır.

Etkinlikler	Sayısı	Süresi (saat)	Toplam İş Yükü (saat)
Ders Saati	14	3	42
Proje	2	30	60
Final Sınavı	1	23	23
Toplam İş Yükü (saat):			125

1 AKTS = 25 saatlik iş yükü

OC1

OC2

OC3

OC4

OC5

Katkı Düzeyi: 1 Düşük, 2 Orta, 3 Yüksek

Dersin Adı	Kodu	Yarıyıl	T+U+L (saat/hafta)	Türü (Z / S)	Yerel Kredi	AKTS
Protein Katlaması	MBG 323	Bahar	03+00+00	Seçmeli	3	5

Akademik Birim:	Moleküler Biyoloji ve Genetik
Öğrenim Türü:	Örgün Eğitim
Ön Koşullar	Yok
Öğrenim Dili:	İngilizce
Dersin Düzeyi:	Lisans
Dersin Koordinatörü:	- -
Dersin Amacı:
Dersin İçeriği:
Dersin Öğrenme Çıktıları (ÖÇ):	1- Protein yapısı tahmini için geliştirilmiş teknikleri kavramak. 2- Hesaplamalı yapı tahmin tekniklerini anladığını örnekleri ile açıklayabilmek. 3- Deneysel verilerin hesaplamalı protein yapısı tahmin araçları ile birlikte kaynaştırabilmek. 4- Protein katlanmasının termodinamiği hakkında bir anlayış kazanın. 5- Globüler ile membran proteinlerinin yapısal özellikleri arasındaki farklılıkları anlamak ve bu yapıları protein yapı tahmin uygulamalarıyla kavrayabilmek.
Dersin Öğrenme Yöntem ve Teknikleri

Hafta	Konular	Ön Hazırlık
1	Kısaca Proteinler	Protein Yapısına Giriş. Çelenk Yayıncılık
2	Proteinlerin yapısal sınıflandırması	Ders Notları
3	Olasılık ve Entropi	Moleküler İtici Kuvvetler, Bölüm 1
4	Entropinin multiplisitesi ve istatistiksel tanımı	Moleküler İtici Kuvvetler, Bölüm 2
5	Protein Katlanmasının Termodinamiği I	Ders Notları
6	Protein Katlanmasının Termodinamiği II	Ders Notları
7	Genel Bakış	Ders Notları ve PDF Dosyaları
8	Ara Sınav	Ara sınav ve çözümleri
9	Protein Geometrisi & Optimizasyon Teknikleri	Yapısal Biyoinformatik, 7. Bölüm
10	Deneysel Teknikler	Proteinler: Yapı ve İşlev
11	Homoloji Modelleme	Yapısal Biyoinformatik, 7. Bölüm. https://salilab.org/modeller/
12	Homoloji Modelleme Uygulama Eğitimi	https://salilab.org/modeller/
13	Proje
14	Membran Proteinleri	Proteins: Structure and Function

Kadir Has Üniversitesi'nde bir dönem 14 haftadır, 15. ve 16. hafta sınav haftalarıdır.

Etkinlikler	Sayısı	Süresi (saat)	Toplam İş Yükü (saat)
Ders Saati	14	3	42
Proje	2	30	60
Final Sınavı	1	23	23
Toplam İş Yükü (saat):			125

1 AKTS = 25 saatlik iş yükü

OC1

OC2

OC3

OC4

OC5

Katkı Düzeyi: 1 Düşük, 2 Orta, 3 Yüksek