DERS TANITIM ve UYGULAMA BİLGİLERİ

Dersin Adı Kodu Yarıyıl T+U+L (saat/hafta) Türü (Z / S) Yerel Kredi AKTS
Karmaşık Sistemler MBG 426 Güz 03+00+00 Seçmeli 3 5
Akademik Birim: Moleküler Biyoloji ve Genetik
Öğrenim Türü: Örgün Eğitim
Ön Koşullar Yok
Öğrenim Dili: İngilizce
Dersin Düzeyi: Lisans
Dersin Koordinatörü: - -
Dersin Amacı: Dersin amacı karmaşık sistemlerin içselleştirilmesi için gerekli araçlar öğrenilmesi ve biyolojik sistemler alanı özelinde problem çözme yeteneklerinin geliştirilmesidir. Moleküler biyoloji ve genetik öğrencilerine göre tasarlanmış bu derste, yaşayan organizmaların oluşturduğu karmaşık sistemler, dinamikleri, kaos, fraktallar, gibi karmaşık sistemlerin temel konularının anlaşılması amaçlanmaktadır. Genel olarak doğada, sosyal sistemlerde ve teknolojik sistemlerde karmaşıklığın neden ortaya çıktığı konusunda da öğrencilere fikir kazandırılması amaçlanmaktadır.
Dersin İçeriği: Karmaşıklık, Dinamik Sistemler, Kaos, Fraktallar, Kendi-kendine organize olma, kolektif hareket, ağlar ve karmaşık sistemlerde ölçeklenme
Dersin Öğrenme Çıktıları (ÖÇ):
  • 1- Karmaşık sistemler ile yaşayan organizmaların incelenmesi
  • 2- Dinamik sistemler ve kaos kavramını anlamak
  • 3- Fraktalların biyolojik sistemlerde oluşma sebeplerini anlamak
  • 4- Kolektif hareketin oluşması ve sürdürülebilirlik için önemini anlamlandırmak
  • 5- Biyolojik sistemlerde ağların incelenmesi
  • 6- Karmaşık sistemlerde ölçeklenme yasaları
Dersin Öğrenme Yöntem ve Teknikleri Haftalık kısa sınavlar, bir ara sınav, bir final sınavı ve ödevler


HAFTALIK PROGRAM

HaftaKonularÖn Hazırlık
1 Karmaşıklık İlgili konunun ders notlarından okunması
2 Karmaşık sistemler analizleri için Python İlgili konunun ders notlarından okunması
3 Dinamik sistemler İlgili konunun ders notlarından okunması
4 Kaos ve logistik denklemi İlgili konunun ders notlarından okunması
5 Fraktallar İlgili konunun ders notlarından okunması
6 İstatistiksel yöntemler ve entropi İlgili konunun ders notlarından okunması
7 Ara Sınav İlk 6 hafta konularının tekrarı
8 Biyolojik sistemlerde kolektif hareket İlgili konunun ders notlarından okunması
9 İş birlikleri ve senkronizasyon İlgili konunun ders notlarından okunması
10 Ağ teorisi İlgili konunun ders notlarından okunması
11 Ağlarda dinamikler İlgili konunun ders notlarından okunması
12 Ağlarda kolektif hareketler İlgili konunun ders notlarından okunması
13 Biyolojik sistemlerde ölçeklenme İlgili konunun ders notlarından okunması
14 Genel Tekrar Tüm dönem anlatılan konuların tekrarı


ZORUNLU ve ÖNERİLEN OKUMALAR

Mitchell, Melanie. Complexity: A guided tour. Oxford University Press, 2009.


DİĞER KAYNAKLAR

Salthe, Stanley N. Development and evolution: complexity and change in biology. Mit Press, 1993.
Bonchev, Danail D., and Dennis Rouvray, eds. Complexity in chemistry, biology, and ecology. Springer Science & Business Media, 2007.


DEĞERLENDİRME SİSTEMİ

Yarıyıl İçi ÇalışmalarıSayıKatkı Payı (%)
Katılım 14 -
Uygulama 5 -
Ödev 10 10
Ara Sınavlar/Sözlü Sınavlar/Kısa Sınavlar 13 50
Final Sınavı 1 40
Total: 43 100


İŞ YÜKÜ HESAPLAMASI

EtkinliklerSayısıSüresi (saat)Toplam İş Yükü (saat)
Ders Saati14342
Uygulama5420
Ödev10220
Ara Sınavlar/Sözlü Sınavlar/Kısa Sınavlar13226
Final Sınavı11717
Toplam İş Yükü (saat):125


PROGRAM YETERLİLİKLERİ (PY) ve ÖĞRENME ÇIKTILARI (ÖÇ) İLİŞKİSİ

# PY1 PY2 PY3 PY4 PY5 PY6 PY7 PY8 PY9 PY10 PY11
OC1                      
OC2                      
OC3                      
OC4                      
OC5                      
OC6