DERS TANITIM ve UYGULAMA BİLGİLERİ

Dersin Adı Kodu Yarıyıl T+U+L (saat/hafta) Türü (Z / S) Yerel Kredi AKTS
Biyoorganik Kimya II MBG 202 Bahar 03+00+00 Zorunlu 3 5
Akademik Birim: MDBF / Moleküler Biyoloji ve Genetik
Öğrenim Türü: Örgün Eğitim
Ön Koşullar Yok
Öğrenim Dili: İngilizce
Dersin Düzeyi: Lisans
Dersin Koordinatörü: - -
Dersin Amacı: Bu araştırma kursu, yaşamın kimyasını anlamak için gerekli genel, organik ve biyolojik kimya
kavramlarına genel bir bakış sunar. Ders MBG201'in devamı niteliğindedir ve Alkoller, Tioller,
Eterler, Aldehitler ve Ketonlar, Karbonhidrat, Karboksilik Asitler, Esterler, Aminler, Amitler,
Lipitler, Amino gibi organik bileşiklerin yapısı, özelliği ve reaksiyonları ve reaktiviteleri
arasındaki ilişkileri vurgular. Asitler ve Proteinler. Bu ders oksidasyon ve redüksiyon
reaksiyonlarının tüm ayrıntılarını öğretir; radikal reaksiyonlar; konjugasyon, yörünge simetrisi,
rezonans, dienler ve ultraviyole (UV/Vis) spektroskopisi; benzen ve aromatik bileşikler ve
bunların elektrofilik aromatik ikameleri (EAS reaksiyonları); karboksilik asitler ve bunların
türevleri, aldehitler, ketonlar ve bunların nükleofilik katılma ve nükleofilik asil ikame
reaksiyonları dahil olmak üzere karbonil bileşikleri; karbonil yoğunlaşma reaksiyonları; aminler;
karbonhidratlar; lipitler; nükleik asitler; Amino asitler, peptidler, proteinler ve enzimler.
Dersin İçeriği: 1- Oksidasyon ve Redüksiyon
2- Radikal Reaksiyonlar
3- Konjugasyon, Orbital Simetri, Rezonans, Dienler ve Ultraviyole (UV/Vis) Spektroskopisi
4- Benzen ve Aromatik Bileşikler
5- Elektrofilik Aromatik Yer Değiştirme (EAS Reaksiyonları)
6- Karboksilik Asitler ve O-H Bağının Asitliği
7- Karbonil Kimyasına Giriş: Organometalik Reaktifler, Yükseltgenme ve İndirgeme
8- Aldehitler ve Ketonlar – Nükleofilik Katılma
9- Karboksilik Asitler ve Türevleri – Nükleofilik Asil Yer Değiştirme
10- Karbonil Bileşiklerinin Alfa Karbondaki Yer Değiştirme Reaksiyonları
11- Karbonil Yoğunlaşma Reaksiyonları
12- Aminler
13- Karbonhidratlar, Lipitler, Nükleik Asitler, Amino Asitler, Peptitler ve Proteinler, ve Enzimler
Dersin Öğrenme Çıktıları (ÖÇ):
  • 1- Yükseltgenme-indirgeme reaktiflerini tanımlayabilme, yükseltgenme-indirgeme reaksiyonlarının sonuçlarını bulabilme; Konjuge sistemleri, rezonansı, dienleri, yörünge simetrisini anlamak ve bu tür moleküller üzerinde Ultraviyole (UV/Vis) Spektroskopisini uygulamak
  • 2- Aromatikliği anlamak, aromatik bileşikleri ve spesifik reaksiyonlarını bilmek
  • 3- Karbonil bileşiklerini tanımak, özelliklerini ve reaktivitelerini anlamak, reaksiyonlarını öğrenmek ve uygulamak
  • 4- Çeşitli karbonil bileşikleri ile nükleofilik katılma ve nükleofilik asil yer değiştirme reaksiyonlarını anlayabilme ve kullanabilme
  • 5- Aminlerin tanımlanması, sentezlerinin ve temel reaksiyonlarının bilinmesi
  • 6- Lipidleri, amino asitleri, enzimleri ve proteinleri ayırt edebilmek ve kimyasını bilmek; DNA ve RNA'nın yapılarını ve nükleik asitlerin kimyasını bilmek
  • 7- Temel organik kimya deneylerinin kurulması ve yürütülmesi
Dersin Öğrenme Yöntem ve Teknikleri Konuyla ilgili önemli görselleri ve günlük örnekleri içeren ve KHAS Learn platformu üzerinden öğrencilerle paylaşılan PowerPoint sunumlar. Ders sırasında öğrencilerle tartışma. Dersler sırasında mekanik/açıklayıcı videolar izlemek ve öğrencilerle tartışmak. Önce/sonra izlenebilecek videolar önermek. Bazı teorik konular için laboratuvarda deneyler yapmak. Öğrenciler deneyi yaptıktan sonra her deneye ait laboratuvar raporları atamak ve değerlendirmek. Eğitmenlerin gözetiminde 2-4 kişilik bir ekiple bir proje yürütmek. KHAS Learn sistemine yüklenen çözülmüş problemler ve haftalık ödevler öğrencilerin kavramları daha iyi anlamalarına ve sınavlara hazırlanmalarına yardımcı olmak.


HAFTALIK PROGRAM

HaftaKonularÖn Hazırlık
1 Oksidasyon ve Redüksiyon İnteraktif anlatım, problem çözme ve laboratuvar uygulamaları
2 Radikal Reaksiyonlar İnteraktif anlatım, problem çözme ve laboratuvar uygulamaları
3 Konjugasyon, Orbital Simetri, Rezonans, Dienler ve Ultraviyole (UV/Vis) Spektroskopisi İnteraktif anlatım, problem çözme ve laboratuvar uygulamaları
4 Benzen ve Aromatik Bileşikler İnteraktif anlatım, problem çözme ve laboratuvar uygulamaları
5 Elektrofilik Aromatik Yer Değiştirme Reaksiyonları İnteraktif anlatım, problem çözme ve laboratuvar uygulamaları
6 Karboksilik Asitler ve O-H Bağının Asitliği İnteraktif anlatım, problem çözme ve laboratuvar uygulamaları
7 Ara Değerlendirmeler Ara Değerlendirmeler (~ dönem ortası ve SINIFTA – çevrimiçi değerlendirme yok)
8 Karbonil Kimyasına Giriş; Organometalik Reaktifler; Oksidasyon ve Redüksiyon İnteraktif anlatım, problem çözme ve laboratuvar uygulamaları
9 Aldehitler ve Ketonlar – Nükleofilik Katılma İnteraktif anlatım, problem çözme ve laboratuvar uygulamaları
10 Karboksilik Asitler ve Türevleri – Nükleofilik Asil Yer Değiştirme İnteraktif anlatım, problem çözme ve laboratuvar uygulamaları
11 α-Karbondaki Karbonil Bileşiklerinin İkame Reaksiyonları İnteraktif anlatım, problem çözme ve laboratuvar uygulamaları
12 Karbonil Yoğunlaşma Reaksiyonları İnteraktif anlatım, problem çözme ve laboratuvar uygulamaları
13 Aminler İnteraktif anlatım, problem çözme ve laboratuvar uygulamaları
14 Karbonhidratlar, Lipitler, Nükleik Asitler, Amino Asitler, Peptit ve Proteinler ve Enzimler İnteraktif anlatım, problem çözme ve laboratuvar uygulamaları


ZORUNLU ve ÖNERİLEN OKUMALAR

• Organic Chemistry, 10th Global Edition, Leroy G. Wade and Jan W. Simek, ISBN 9781292424255 (2022) (Course
Book); • Organic Chemistry, T. W. Graham Solomons, Craig B. Fryhle, Scott, Snyder, John Wiley & Sons, Inc. 11th
edition. Binder-ready version ISBN 978-1-118-14739-9, 2016; • Organic Chemistry, Jonathan Clayden, Nick Greeves,
and Stuart Warre, 978-0-19-927029-3, Second Edition, 2012; • J. Mc Murry, Organic Chemistry, Brooks/Cole
Publishing R. T. Morrison and R. N. Boyd, Organic Chemistry, Prentice Hall; • Pearson MyLab online platforms will be
used to assign additional homework assignments; • JoVE Scientific Video Journal will be used to support the lecture
visually; • All details will be uploaded to the KHAS Learn


DİĞER KAYNAKLAR

Lecture slides used in the class (accessible by the students via Learn System)
Laboratory Manual Booklet
Suggested web site: https://www.jove.com/education/core


DEĞERLENDİRME SİSTEMİ

Yarıyıl İçi ÇalışmalarıSayıKatkı Payı (%)
Katılım 14 10
Uygulama 12 -
Ödev 14 20
Dersle İlgili Sınıf Dışı Etkinlikler (okuma, bireysel çalışma vb.) 8 -
Ara Sınavlar/Sözlü Sınavlar/Kısa Sınavlar 1 30
Final Sınavı 1 40
Total: 50 100


İŞ YÜKÜ HESAPLAMASI

EtkinliklerSayısıSüresi (saat)Toplam İş Yükü (saat)
Ders Saati14342
Uygulama12224
Ödev14114
Dersle İlgili Sınıf Dışı Etkinlikler818
Ara Sınavlar/Sözlü Sınavlar/Kısa Sınavlar11212
Final Sınavı12525
Toplam İş Yükü (saat):125


PROGRAM YETERLİLİKLERİ (PY) ve ÖĞRENME ÇIKTILARI (ÖÇ) İLİŞKİSİ

# PY1 PY2 PY3 PY4 PY5 PY6 PY7 PY8 PY9
OC1   2 3 1 2     2  
OC2     3            
OC3     3 1          
OC4   2 3            
OC5   2 3            
OC6   2 3            
OC7   2 3   2     2