DERS TANITIM ve UYGULAMA BİLGİLERİ

Dersin Adı Kodu Yarıyıl T+U+L (saat/hafta) Türü (Z / S) Yerel Kredi AKTS
Biyoorganik Kimya Lab I MBG 221 Güz 00+00+02 Zorunlu 1 1
Akademik Birim: MDBF / Moleküler Biyoloji ve Genetik
Öğrenim Türü: Örgün Eğitim
Ön Koşullar Yok
Öğrenim Dili: İngilizce
Dersin Düzeyi: Lisans
Dersin Koordinatörü: - -
Dersin Amacı: Dersin amacı organik kimyanın temel kavramlarını mantıksal ve sistematik olarak sunmaktır.
Bu giriş dersi aynı zamanda organik bileşiklerin yapısı, özelliği ve reaktivitesi arasındaki ilişkileri
de vurgulayacaktır. Ders asitleri ve bazları, fonksiyonel grupları, alkanların, alkenlerin ve
alkinlerin yapısını ve stereokimyasını kapsar. Alkollerin yapısı, sentezi ve reaksiyonları ile
Nükleofilik yer değiştirme ve eliminasyon reaksiyonları derste yer almaktadır. Son olarak
organik bileşikleri tanımlamak için Kızılötesi ve Nükleer Manyetik Rezonans Spektroskopisi ve
Kütle Spektrometrisi tanıtılacaktır.
Dersin İçeriği: 1- Laboratuvar Güvenliği
2- Laboratuvar Ekipmanlarının Kullanımı
3- HİDROKARBONLARIN TANIMLANMASI
4- FONKSİYONEL GRUP BELİRLEME
5- DOĞAL BİR ÜRÜNÜN İZOLASYONU: ÇAYDAN KAFEİNİN EKSTRAKSİYONU
6- YER DEĞİŞTİRME (SN1) REAKSİYONU: t-BÜTİL KLORÜR SENTEZİ
7- ELİMİNASYON (E1) REAKSİYONU: SİKLOHEKSANOLÜN DEHİDRASYONU
8- NÜKLEOFİLİK ALİFATİK YER DEĞİŞTİRME REAK.: ETİL BROMÜR SENTEZİ
9- ALKOLLERİN TESPİTİ
10- SPEKTROSKOPİ (IR ve UV)
Dersin Öğrenme Çıktıları (ÖÇ):
  • 1- Elektron-nokta formüllerinin çizilmesi
  • 2- Moleküllerin şeklini tahmin etmek, görselleştirmek ve üç boyutlu olarak çizmek, onları iki boyuta çevirmek ve yansıtmak; Kimyasal bir denklemin dengelenmesi; Göreceli asit/baz kuvvetinin sıralanması; Alkanları, alkenleri ve alkinleri adlandırma ve çizme
  • 3- Döngüsel olmayan ve döngüsel sistemlerde konformasyonu etkileyen faktörlerin açıklanması
  • 4- Verilen moleküler formüle göre fonksiyonel grupların tanımlanması ve olası izomerlerin ve fonksiyonel grupların yapılarının yazılması; Optik olarak aktif bileşiklerin tanınması
  • 5- SN2, SN1 mekanizmalarını, SN2 ve SN1 reaksiyon hızlarını etkileyen faktörleri anlamak ve alkil halojenürlerin eliminasyon reaksiyonlarını, E2 ve E1 mekanizmalarını anlamak.
  • 6- Alkollerin, eterlerin, epoksitlerin, alkenlerin ve alkinlerin yapılarını, reaksiyonlarını ve sentezlerini anlamak
  • 7- Kızılötesi Spektroskopi, Kütle Spektrometrisi ve Nükleer Manyetik ve Rezonans Spektroskopisinin Yorumlanması
Dersin Öğrenme Yöntem ve Teknikleri KHAS Learn platformu aracılığıyla öğrencilerle de paylaşılan laboratuvar deneyleri için laboratuvar kılavuzunun sağlanması. Laboratuvar dersi sırasında öğrencilerle tartışma. Dersler sırasında mekanik/açıklayıcı videolar izlemek ve öğrencilerle tartışmak. Öncesi/sonrası izlenecek videolar öneriliyor. Teorik konuların bir kısmı için laboratuvarda deneyler yapılır. Her deneyin laboratuvar raporları öğrenciler deneyi yaptıktan sonra atanır ve değerlendirilir. Eğitmenlerin gözetiminde 2-4 kişilik bir ekiple proje yürütülür. Learn sistemine yüklenen bilgiler ve haftalık laboratuvar raporu ödevleri, öğrencilerin kavramları daha iyi anlamalarına ve değerlendirmelere hazırlanmalarına yardımcı olacaktır.


HAFTALIK PROGRAM

HaftaKonularÖn Hazırlık
1 Laboratuvar Güvenliği İnteraktif ders ve laboratuvar uygulamaları
2 Laboratuvar Ekipmanlarının Kullanımı İnteraktif ders ve laboratuvar uygulamaları
3 HİDROKARBONLARIN TANIMLANMASI Okuma kılavuzu, etkileşimli ders, laboratuvar projeleri ve değerlendirmeler
4 FONKSİYONEL GRUP BELİRLEME Okuma kılavuzu, etkileşimli ders, laboratuvar projeleri ve değerlendirmeler
5 DOĞAL BİR ÜRÜNÜN İZOLASYONU: ÇAYDAN KAFEİNİN EKSTRAKSİYONU Okuma kılavuzu, etkileşimli ders, laboratuvar projeleri ve değerlendirmeler
6 YER DEĞİŞTİRME (SN1) REAKSİYONU: t-BÜTİL KLORÜR SENTEZİ Ara Değerlendirmeler (~ dönem ortası ve SINIFTA – çevrimiçi değerlendirme yok)
7 Ara Değerlendirmeler Okuma kılavuzu, etkileşimli ders, laboratuvar projeleri ve değerlendirmeler
8 ELİMİNASYON (E1) REAKSİYONU: SİKLOHEKSANOLÜN DEHİDRASYONU Okuma kılavuzu, etkileşimli ders, laboratuvar projeleri ve değerlendirmeler
9 NÜKLEOFİLİK ALİFATİK YER DEĞİŞTİRME REAKSİYONU: ETİL BROMÜR SENTEZİ Okuma kılavuzu, etkileşimli ders, laboratuvar projeleri ve değerlendirmeler
10 ALKOLLERİN TESPİTİ Okuma kılavuzu, etkileşimli ders, laboratuvar projeleri ve değerlendirmeler
11 SPEKTROSKOPİ (IR ve UV) Okuma kılavuzu, etkileşimli ders, laboratuvar projeleri ve değerlendirmeler
12 TELAFİLER Okuma kılavuzu, etkileşimli ders, laboratuvar projeleri ve değerlendirmeler
13 Final Değerlendirmeleri Final Değerlendirmeleri (~ dönem sonu VE LAB'de – çevrimiçi değerlendirme yok
14 Final Değerlendirmeleri Final Değerlendirmeleri (~ dönem sonu VE LAB'de – çevrimiçi değerlendirme yok


ZORUNLU ve ÖNERİLEN OKUMALAR

• Lab Manual by M. Mustafa Cetin and Mine Cengiz Cetin; • Organic Chemistry, 10th Global Edition, Leroy G. Wade and
Jan W. Simek, ISBN 9781292424255 (2022) (Course Book); • Organic Chemistry, T. W. Graham Solomons, Craig B.
Fryhle, Scott, Snyder, John Wiley & Sons, Inc. 11th edition. Binder-ready version ISBN 978-1-118-14739-9, 2016; •
Organic Chemistry, Jonathan Clayden, Nick Greeves, and Stuart Warre, 978-0-19-927029-3, Second Edition, 2012; • J.
Mc Murry, Organic Chemistry, Brooks/Cole Publishing R. T. Morrison and R. N. Boyd, Organic Chemistry, Prentice Hall; •
Pearson MyLab online platforms will be used to assign additional homework assignments; • JoVE Scientific Video Journal
will be used to support the lecture visually; • All details will be uploaded to the KHAS Learn


DİĞER KAYNAKLAR

Lab materials used in the lab (accessible by the students via Learn System)
Laboratory Manual Booklet
Suggested web site: https://www.jove.com/education/core


DEĞERLENDİRME SİSTEMİ

Yarıyıl İçi ÇalışmalarıSayıKatkı Payı (%)
Katılım 14 5
Laboratuvar 2 5
Final Sınavı 1 40
Ara Sınavlar 1 25
Kısa Sınavlar 12 25
Total: 30 100


İŞ YÜKÜ HESAPLAMASI

EtkinliklerSayısıSüresi (saat)Toplam İş Yükü (saat)
Ders Saati14114
Laboratuvar20.51
Final Sınavı111
Ara Sınavlar133
Kısa Sınavlar120.56
Toplam İş Yükü (saat):25


PROGRAM YETERLİLİKLERİ (PY) ve ÖĞRENME ÇIKTILARI (ÖÇ) İLİŞKİSİ

# PY1 PY2 PY3 PY4 PY5 PY6 PY7 PY8 PY9
OC1             2    
OC2 1         2 1    
OC3 1         2      
OC4 1         2      
OC5 1         2      
OC6 1         2      
OC7 1         2