DERS TANITIM ve UYGULAMA BİLGİLERİ

Dersin Adı Kodu Yarıyıl T+U+L (saat/hafta) Türü (Z / S) Yerel Kredi AKTS
Biyoorganik Kimya Lab II MBG 222 Bahar 00+00+02 Zorunlu 1 1
Akademik Birim: MDBF / Moleküler Biyoloji ve Genetik
Öğrenim Türü: Örgün Eğitim
Ön Koşullar Yok
Öğrenim Dili: İngilizce
Dersin Düzeyi: Lisans
Dersin Koordinatörü: - -
Dersin Amacı: Bu araştırma kursu, yaşamın kimyasını anlamak için gerekli genel, organik ve biyolojik kimya
kavramlarına genel bir bakış sunar. Ders MBG221'in devamı niteliğindedir ve Alkoller, Tioller,
Eterler, Aldehitler ve Ketonlar, Karbonhidrat, Karboksilik Asitler, Esterler, Aminler, Amitler,
Lipitler, Amino gibi organik bileşiklerin yapısı, özelliği ve reaksiyonları ve reaktiviteleri
arasındaki ilişkileri vurgular. Asitler ve Proteinler. Bu ders oksidasyon ve redüksiyon
reaksiyonlarının tüm ayrıntılarını öğretir; radikal reaksiyonlar; konjugasyon, yörünge simetrisi,
rezonans, dienler ve ultraviyole (UV/Vis) spektroskopisi; benzen ve aromatik bileşikler ve
bunların elektrofilik aromatik ikameleri (EAS reaksiyonları); karboksilik asitler ve bunların
türevleri, aldehitler, ketonlar ve bunların nükleofilik katılma ve nükleofilik asil ikame
reaksiyonları dahil olmak üzere karbonil bileşikleri; karbonil yoğunlaşma reaksiyonları; aminler;
karbonhidratlar; lipitler; nükleik asitler; Amino asitler, peptidler, proteinler ve enzimler
Dersin İçeriği: 1- Laboratuvar Güvenliği
2- Laboratuvar Ekipmanlarının Kullanımı
3- ALKOLLERİN OKSİDASYONU: SİKLOHEKSANON SENTEZİ
4- ELEKTROFİLİK AROMATİK YER DEĞİŞTİRME (EAS) REAK.: NİTROBENZEN SENTEZİ
5- NÜKLEOFİLİK AÇİL YER DEĞİŞTİRME REAK.: ETİL ASETAT SENTEZİ
6- SCHIFF BAZI SENTEZİ: N-BENZİLİDENANİLİNİN SENTEZİ
7- AZO BOYA SENTEZİ (FENİL AZO β-NAFTOL)
8- ESTERİFİKASYON: SABUN SENTEZİ
9- ALDOL KONDENZASYONU: DİBENZALASETON SENTEZİ
10- CANNIZZARO REAKSİYONU
11- KOLON KROMATOGRAFİSİ (CC) & İNCE TABAKA KROMATOGRAFİSİ (TLC)
Dersin Öğrenme Çıktıları (ÖÇ):
  • 1- Yükseltgenme-indirgeme reaktiflerini tanımlayabilme, yükseltgenme-indirgeme reaksiyonlarının sonuçlarını bulabilme; Konjuge sistemleri, rezonansı, dienleri, yörünge simetrisini anlamak ve bu tür moleküller üzerinde Ultraviyole (UV/Vis) Spektroskopisini uygulamak
  • 2- Aromatikliği anlamak, aromatik bileşikleri ve spesifik reaksiyonlarını bilmek
  • 3- Karbonil bileşiklerini tanımak, özelliklerini ve reaktivitelerini anlamak, reaksiyonlarını öğrenmek ve uygulamak
  • 4- Çeşitli karbonil bileşikleri ile nükleofilik katılma ve nükleofilik asil yer değiştirme reaksiyonlarını anlayabilme ve kullanabilme
  • 5- Aminlerin tanımlanması, sentezlerinin ve temel reaksiyonlarının bilinmesi
  • 6- Lipidleri, amino asitleri, enzimleri ve proteinleri ayırt edebilmek ve kimyasını bilmek; DNA ve RNA'nın yapılarını ve nükleik asitlerin kimyasını bilmek
  • 7- Temel organik kimya deneylerinin kurulması ve yürütülmesi
Dersin Öğrenme Yöntem ve Teknikleri KHAS Learn platformu aracılığıyla öğrencilerle de paylaşılan laboratuvar deneyleri için laboratuvar kılavuzunun sağlanması. Laboratuvar dersi sırasında öğrencilerle tartışma. Dersler sırasında mekanik/açıklayıcı videolar izlemek ve öğrencilerle tartışmak. Öncesi/sonrası izlenecek videolar öneriliyor. Teorik konuların bir kısmı için laboratuvarda deneyler yapılır. Her deneyin laboratuvar raporları öğrenciler deneyi yaptıktan sonra atanır ve değerlendirilir. Eğitmenlerin gözetiminde 2-4 kişilik bir ekiple proje yürütülür. Learn sistemine yüklenen bilgiler ve haftalık laboratuvar raporu ödevleri, öğrencilerin kavramları daha iyi anlamalarına ve değerlendirmelere hazırlanmalarına yardımcı olacaktır.


HAFTALIK PROGRAM

HaftaKonularÖn Hazırlık
1 Laboratuvar Güvenliği İnteraktif ders ve laboratuvar uygulamaları
2 Laboratuvar Ekipmanlarının Kullanımı İnteraktif ders ve laboratuvar uygulamaları
3 ALKOLLERİN OKSİDASYONU: SİKLOHEKSANON SENTEZİ Okuma kılavuzu, etkileşimli ders, laboratuvar projeleri ve değerlendirmeler
4 ELEKTROFİLİK AROMATİK YER DEĞİŞTİRME (EAS) REAK.: NİTROBENZEN SENTEZİ Okuma kılavuzu, etkileşimli ders, laboratuvar projeleri ve değerlendirmeler
5 NÜKLEOFİLİK AÇİL YER DEĞİŞTİRME REAK.: ETİL ASETAT SENTEZİ Okuma kılavuzu, etkileşimli ders, laboratuvar projeleri ve değerlendirmeler
6 SCHIFF BAZI SENTEZİ: N-BENZİLİDENANİLİNİN SENTEZİ Okuma kılavuzu, etkileşimli ders, laboratuvar projeleri ve değerlendirmeler
7 Ara Değerlendirmeler Ara Değerlendirmeler (~ dönem ortası ve SINIFTA – çevrimiçi değerlendirme yok)
8 AZO BOYALAR: FENİL AZO β-NAFTOL SENTEZİ Okuma kılavuzu, etkileşimli ders, laboratuvar projeleri ve değerlendirmeler
9 ESTERİFİKASYON: SABUN SENTEZİ Okuma kılavuzu, etkileşimli ders, laboratuvar projeleri ve değerlendirmeler
10 ALDOL KONDENZASYONU: DİBENZALASETON SENTEZİ Okuma kılavuzu, etkileşimli ders, laboratuvar projeleri ve değerlendirmeler
11 CANNIZZARO REAKSİYONU Okuma kılavuzu, etkileşimli ders, laboratuvar projeleri ve değerlendirmeler
12 KOLON KROMATOGRAFİSİ (CC) & İNCE TABAKA KROMATOGRAFİSİ (TLC) Okuma kılavuzu, etkileşimli ders, laboratuvar projeleri ve değerlendirmeler
13 TELAFİLER Okuma kılavuzu, etkileşimli ders, laboratuvar projeleri ve değerlendirmeler
14 Final Değerlendirmeleri Final Değerlendirmeleri (~ dönem sonu VE LAB'de – çevrimiçi değerlendirme yok)


ZORUNLU ve ÖNERİLEN OKUMALAR

• Lab Manual by M. Mustafa Cetin and Mine Cengiz Cetin; • Organic Chemistry, 10th Global Edition, Leroy G. Wade
and Jan W. Simek, ISBN 9781292424255 (2022) (Course Book); • Organic Chemistry, T. W. Graham Solomons,
Craig B. Fryhle, Scott, Snyder, John Wiley & Sons, Inc. 11th edition. Binder-ready version ISBN 978-1-118-14739-9,
2016; • Organic Chemistry, Jonathan Clayden, Nick Greeves, and Stuart Warre, 978-0-19-927029-3, Second Edition,
2012; • J. Mc Murry, Organic Chemistry, Brooks/Cole Publishing R. T. Morrison and R. N. Boyd, Organic Chemistry,
Prentice Hall; • Pearson MyLab online platforms will be used to assign additional homework assignments; • JoVE
Scientific Video Journal will be used to support the lecture visually; • All details will be uploaded to the KHAS Learn


DİĞER KAYNAKLAR

Lab materials used in the lab (accessible by the students via Learn System)
Laboratory Manual Booklet
Suggested web site: https://www.jove.com/education/core


DEĞERLENDİRME SİSTEMİ

Yarıyıl İçi ÇalışmalarıSayıKatkı Payı (%)
Katılım 14 5
Laboratuvar 2 5
Final Sınavı 1 40
Ara Sınavlar 1 25
Kısa Sınavlar 12 25
Total: 30 100


İŞ YÜKÜ HESAPLAMASI

EtkinliklerSayısıSüresi (saat)Toplam İş Yükü (saat)
Ders Saati14114
Laboratuvar20.51
Final Sınavı111
Ara Sınavlar133
Kısa Sınavlar120.56
Toplam İş Yükü (saat):25


PROGRAM YETERLİLİKLERİ (PY) ve ÖĞRENME ÇIKTILARI (ÖÇ) İLİŞKİSİ

# PY1 PY2 PY3 PY4 PY5 PY6 PY7 PY8 PY9
OC1   2 3 1 2     2  
OC2     3            
OC3     3 1          
OC4   2 3            
OC5   2 3            
OC6   2 3            
OC7   2 3   2     2