DERS TANITIM ve UYGULAMA BİLGİLERİ

Dersin Adı Kodu Yarıyıl T+U+L (saat/hafta) Türü (Z / S) Yerel Kredi AKTS
Moleküler Biyolojide Modern Teknikler MBG 401 Güz 03+00+00 Seçmeli 3 5
Akademik Birim: MDBF / Moleküler Biyoloji ve Genetik
Öğrenim Türü: Örgün Eğitim
Ön Koşullar Yok
Öğrenim Dili: İngilizce
Dersin Düzeyi: Lisans
Dersin Koordinatörü: - -
Dersin Amacı: Bu dersin amacı moleküler biyoloji ve genetik alanında kullanılan çığır açıcı teknikleri tanıtmaktır. Optogenetik, genom modülasyonu, tek hücre dizileme, ışık levha floresan mikroskopisi, tek parçacıklı kriyo-elektron mikroskopisi, organoidler, serbest hareket eden canlıların karmaşık hareketlerinin gözlenmesi, tek hücre çok modaliteli analizler, uzamsal çözümlenmiş transkriptom analizi, uzun okumalı dizilemeler ve gelişim biyolojisi alanındaki güncel modeller ders kapsamında işlenecektir.
Dersin İçeriği: Optogenetik, genom modülasyonu, tek hücre dizileme, ışık levha floresan mikroskopisi, tek parçacıklı kriyo-elektron mikroskopisi, organoidler, serbest hareket eden canlıların karmaşık hareketlerinin gözlenmesi, tek hücre çok modaliteli analizler, uzamsal çözümlenmiş transkriptom analizi, uzun okumalı dizilemeler ve gelişim biyolojisi alanındaki güncel modeller
Dersin Öğrenme Çıktıları (ÖÇ):
  • 1- Araştırmalarda kullanılacak yöntemler hakkında geniş bir spektrumda bilgi sahibi olur.
  • 2- Araştırma sorularına göre hangi yöntemin başarılı sonuçlar vereceğini öngörür.
  • 3- Deneysel, biyoenformatik ve hesaplamalı biyoloji alanlarındaki gelişmeleri bilir.
  • 4- Kodlama becerileri gelişir.
  • 5- Akademik yayın okuma, yorumlama ve yazma becerileri gelişir.
Dersin Öğrenme Yöntem ve Teknikleri Sunum, Ders Notları


HAFTALIK PROGRAM

HaftaKonularÖn Hazırlık
1 Moleküler biyolojide modern tekniklere genel bakış Ders materyalleri ve makaleler
2 Optogenetik Ders materyalleri ve makaleler
3 Işık levha floresan mikroskopisi Ders materyalleri ve makaleler
4 Tek parçacıklı kriyo-elektron mikroskopisi Ders materyalleri ve makaleler
5 Organoidler Ders materyalleri ve makaleler
6 Genom modülasyonu Ders materyalleri ve makaleler
7 Genom modülasyonu Ders materyalleri ve makaleler
8 Uzun okumalı dizilemeler Ders materyalleri ve makaleler
9 Tek hücre dizileme Ders materyalleri ve makaleler
10 Uzamsal çözümlenmiş transkriptom analizi Ders materyalleri ve makaleler
11 Tek hücre çok modaliteli analizler Ders materyalleri ve makaleler
12 Tek hücre çok modaliteli analizler Ders materyalleri ve makaleler
13 Davranış biyolojisi Ders materyalleri ve makaleler
14 Gelişim biyolojisi alanındaki güncel modeller Ders materyalleri ve makaleler


ZORUNLU ve ÖNERİLEN OKUMALAR

CRISPR-/Cas9 Based Genome Editing for Treating Genetic Disorders and Diseases, Luis Maria Vaschetto, CRC Press, 2024, ISBN: 9780367542870
Tissue Engineering Strategies for Organ Regeneration, Shikha Chawla, Juhi Chakraborty, Sourabh Ghosh, CRC Press, 2020, ebook ISBN 9780429422652
Bioinformatics Methods From Omics to Next Generation Sequencing, Shili Lin, Denise Scholtens, Sujay Datta, Chapman & Hall, 2022, ISBN 9781498765152
Bioinformatics and Computational BiologyTechnological Advancements, Applications and Opportunities, Tiratha Raj Singh, Hemraj Saini, Moacyr Comar Junior, Chapman & Hall, 2023, ISBN 9781032361581


DİĞER KAYNAKLAR

İlgili hafta konusuyla ilişkili seçilmiş güncel yayınlar


DEĞERLENDİRME SİSTEMİ

Yarıyıl İçi ÇalışmalarıSayıKatkı Payı (%)
Katılım 14 -
Proje 1 30
Ödev 1 15
Sunum/Jüri 1 30
Dersle İlgili Sınıf Dışı Etkinlikler (okuma, bireysel çalışma vb.) 3 -
Kısa Sınavlar 10 25
Total: 30 100


İŞ YÜKÜ HESAPLAMASI

EtkinliklerSayısıSüresi (saat)Toplam İş Yükü (saat)
Ders Saati14342
Proje12020
Ödev11818
Sunum/Jüriye Hazırlık12020
Dersle İlgili Sınıf Dışı Etkinlikler3515
Kısa Sınavlar10110
Toplam İş Yükü (saat):125


PROGRAM YETERLİLİKLERİ (PY) ve ÖĞRENME ÇIKTILARI (ÖÇ) İLİŞKİSİ

# PY1 PY2 PY3 PY4 PY5 PY6 PY7 PY8 PY9 PY10 PY11 PY12 PY13
OC1                          
OC2                          
OC3                          
OC4                          
OC5